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同行评议开放获取传染性非典型肺炎新型冠状病毒感染

Utilizing river and wastewater as a SARS-CoV-2 surveillance tool in settings with limited formal sewage systems

Nature Communications·

Kayla G. Barnes, Joshua I. Levy, Jillian Gauld, Jonathan Rigby, Oscar Kanjerwa, Christopher B. Uzzell, Chisomo Chilupsya, Catherine Anscombe, Christopher Tomkins-Tinch, Omar Mbeti, Edward Cairns, Herbert Thole, Shannon McSweeney, Marah G. Chibwana, Philip M. Ashton, Khuzwayo C. Jere, John Scott Meschke, Peter Diggle, Jennifer Cornick, Benjamin Chilima, Kondwani Jambo, Kristian G. Andersen, Gift Kawalazira, Steve Paterson, Tonney S. Nyirenda, Nicholas Feasey

DOI
10.1038/s41467-023-43047-y
PMID
38036496
PMCID
PMC10689440
OpenAlex
W4389193853
研究类型
Journal article
出版商
Springer Science and Business Media LLC
文章类型
journal-article
完整性状态
current

为何这项研究现在值得关注

基于水体的监测可在缺乏正规污水基础设施和完善社区检测项目的环境中,为COVID-19疫情波次提供预警并识别关注变异株。

01

结构化证据摘要

研究问题

该研究探讨在马拉维这一缺乏正规污水系统和社区检测能力的低收入国家,河流和废水采样能否作为SARS-CoV-2监测工具。

研究设计

研究者在2020年5月至2022年5月期间从马拉维最多112个河流或废弃污水处理厂采样点采集水样。对阳性样本进行SARS-CoV-2检测并测序以识别流行变异株。

人群与场景

研究在马拉维开展,该国为低收入国家,社区COVID-19检测能力有限且无正规污水系统。

主要发现

8.3%的水样检出SARS-CoV-2。水样检测高峰早于临床病例高峰。测序识别出Beta、Delta和Omicron变异株,其中Delta和Omicron在水样中的检出时间明显早于患者样本。

公共卫生意义

基于水体的监测可在缺乏正规污水基础设施和完善社区检测项目的环境中,为COVID-19疫情波次提供预警并识别关注变异株。

重要局限

本摘要依据所提供的单篇文章摘要和书目元数据。关于采样方法、检测灵敏度、时间分辨率和可推广性的完整解读需查阅完整发表论文。

GIDS 解读

该文章展示了环境水体采样如何在资源有限环境中检测SARS-CoV-2 RNA和变异株。它为临床检测基础设施稀缺地区的病原体监测方法提供参考,但本身并不构成监测信号数据。

02

相关 GIDS 监测

文献背景不会验证、解释或改变监测信号;精确关系与背景关系会分开展示。

03

证据关系

本文与疾病、地区、主题及研究设计之间有 10 条可审计分类关系。

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