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同行评议开放获取肺结核淋病

Understanding the potential role of whole genome sequencing (WGS) in managing patients with gonorrhoea: A systematic review of WGS use on human pathogens in individual patient care

Journal of Infection·

Roeann Osman, Emily Dema, Alexandra David, Gwenda Hughes, Nigel Field, Michelle Cole, Xavier Didelot, John Saunders

DOI
10.1016/j.jinf.2024.106168
PMID
38670270
PMCID
OpenAlex
W4395085281
研究类型
Systematic review
出版商
Elsevier BV
文章类型
journal-article
完整性状态
current

为何这项研究现在值得关注

该综述提示,全基因组测序可能有助于了解性传播网络中的病原体传播情况,从而支持对性传播感染进行更有针对性的患者管理。不过,现有证据仅来自少量研究,且参与者数量较少。

01

结构化证据摘要

研究问题

该综述考察了全基因组测序如何以实时或近实时方式用于指导人类病原体的临床干预,并关注其中可能适用于淋病患者管理的信息。

研究设计

这是一项系统综述,检索了六个数据库中2010年1月至2023年2月发表的文章。符合条件的研究不限类型和场所,但必须报告将人类病原体全基因组测序以实时或近实时方式用于指导临床干预。

人群与场景

综述纳入了8项将全基因组测序用于结核病(7项研究)和淋病(1项研究)临床患者管理的研究。这些研究的参与者数量较少。

主要发现

在2项研究中,全基因组测序与临床和流行病学数据结合用于支持接触者追踪;在5项研究中用于指导抗菌治疗;在1项研究中用于识别交叉污染。在淋病研究中,测序发现了通过伴侣通知未识别出的传播链。

公共卫生意义

该综述提示,全基因组测序可能有助于了解性传播网络中的病原体传播情况,从而支持对性传播感染进行更有针对性的患者管理。不过,现有证据仅来自少量研究,且参与者数量较少。

重要局限

综述作者指出,仅识别出8项研究,且这些研究的参与者数量较少。本摘要依赖所提供的单篇文章摘要和元数据;若要进行可用于决策的解释,需要查阅原始论文。

GIDS 解读

该系统综述被归入基因组流行病学、暴发调查、传播动态、抗菌药物耐药性和治疗主题,疾病关联包括结核病和淋病。文章为了解全基因组测序如何用于跨病原体的个体患者管理提供了背景信息,这些信息可能为未来性传播感染监测或干预设计提供参考。

02

相关 GIDS 监测

文献背景不会验证、解释或改变监测信号;精确关系与背景关系会分开展示。

03

证据关系

本文与疾病、地区、主题及研究设计之间有 11 条可审计分类关系。

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