A genomic toolkit for surveillance and elimination of the principal malaria vectors in Southeast Asia.
Wellcome Open Research
- 类型
- 期刊论文
- 范围
- 孟加拉国、柬埔寨、泰国
为何现在值得关注 该工具包被定位为东南亚基因组监测的基础，可为媒介控制提供信息并支持疟疾消除策略；当地媒介生态类型多样，且存在多种生理性杀虫剂抗性表型，使控制工作更为复杂。
Genomic epidemiology
通过可审计分类流程与“Genomic epidemiology”主题关联的研究雷达已发布记录。
- 已发布证据
- 722
- 疾病
- 109
- 国家和地区
- 165
- 主题
- 13
证据流
已发布文献
显示 722 篇文献中的 30 篇
Epidemiological and phylogenetic analysis of anthrax in Kazakhstan in 2024
Infection, Genetics and Evolution
- 类型
- 基因组研究
- 范围
- 哈萨克斯坦
为何现在值得关注 研究结果表明中亚既定地方性地区炭疽持续存在且人畜共患传播持续进行，主要通过家畜接触传播，支持将基因组学监测纳入国家疫情调查和应对计划。
A One Health Molecular Investigation and Exploratory Epidemiological Analysis of Cryptosporidium spp. in A Shared Human-Animal Ecosystem.
Veterinary medicine and science
- 类型
- 横断面研究
- 范围
- 孟加拉国
为何现在值得关注 结果提示在低资源农村地区，隐孢子虫病可能经由水源和卫生暴露界面传播，符合同一健康理念。
Tularemia: una zoonosis reemergente
Medicina Clínica
- 类型
- 基因组研究
- 范围
- 美国、奥地利、西班牙
为何现在值得关注 极高毒力、低感染剂量及生物恐怖分类，凸显需更新临床与诊断指引以支持防范。
Middle East Respiratory Syndrome Coronavirus in Camels, Kazakhstan, 2025.
Emerging infectious diseases
- 类型
- 基因组研究
- 范围
- 哈萨克斯坦
为何现在值得关注 研究结果提示该地区存在潜在的人畜共患传播风险，并强调有必要加强区域监测能力。
Genomic surveillance meets clinical practice: rule-based individualized treatment prediction for gonorrhoea using SensiTyper
Nature Communications
- 类型
- 基因组研究
- 范围
- 未分类
为何现在值得关注 作者将广泛耐药淋球菌视为经验性治疗的威胁，并将该工具定位为支持抗菌药物管理及对XDR分离株开展针对性公共卫生随访。
Biotechnology-Enabled Diagnosis and Treatment of Drug-Resistant Tuberculosis in the Philippines
SN Comprehensive Clinical Medicine
- 类型
- 期刊论文
- 范围
- 菲律宾
为何现在值得关注 在具韧性的路径中整合快速检测、治疗选择、监测与公平可及，是减轻菲律宾耐药结核病负担的关键。
Bovine myxovirus resistance protein (Mx)1, but not Mx2, mediates antiviral activity against human and avian influenza A viruses, including H5N1 clade 2.3.4.4b
Journal of Virology
- 类型
- 基因组研究
- 范围
- 美国
为何现在值得关注 研究表明H5N1在牛群中持续传播可能促使其演化出逃逸Mx防御的变化，从而提升外溢或大流行风险。
Molecular Characterization of IS1111-Positive Tick Pools from Punjab, Pakistan Reveals Clade C Coxiella-like Endosymbionts
Veterinary Sciences
- 类型
- 基因组研究
- 范围
- 巴基斯坦
为何现在值得关注 研究提示仅用IS1111检测易致误判，需确认性测序；并凸显该地区贝氏柯克斯体生态认知缺口。
Pan-Coronavirus Molecular Surveillance in Stool Samples from Patients with Acute Gastroenteritis: SARS-CoV-2 as the Only Coronavirus Detected
Pathogens
- 类型
- 基因组研究
- 范围
- 未分类
为何现在值得关注 研究提供了粪便中冠状病毒RNA的基线数据，提示粪便筛查可补充未来一体化健康监测，但RNA存在不等于具有感染性。
Spatial Distribution and Genetic Diversity of Highly Pathogenic Avian Influenza A (H5N1) in Bulgaria, 2024–2026
Life
- 类型
- 基因组研究
- 范围
- 保加利亚
为何现在值得关注 整合空间、时间与基因监测有助于识别高风险区域并加强保加利亚高致病性禽流感的防控。
Genomic epidemiology of multidrug-resistant and non-multidrug-resistant clinical Salmonella enterica isolates in Guangdong, China
Frontiers in Cellular and Infection Microbiology
- 类型
- 基因组研究
- 范围
- Guangdong, China
为何现在值得关注 上述基因组差异为广东地区监测多重耐药伤寒沙门菌提供了基础。
Phylogenetic inconsistency of pairwise SNP clustering for inferring tuberculosis transmission in a high-burden, endemic setting: a case study from Thailand
mSystems
- 类型
- 基因组研究
- 范围
- 泰国、英国
为何现在值得关注 在高负担 endemic 地区，简易SNP阈值聚类可能误判传播；建议改用尊重进化的系统发育方法以准确划分集群。
Unravelling the transmission dynamics and evolutionary trajectory of mpox in South Korea: 2022-2025 outbreak.
Emerging microbes & infections
- 类型
- 期刊论文
- 范围
- 韩国
为何现在值得关注 将基因组监测与针对性干预结合，有助于刻画传播模式并监测具公共健康意义的病毒变化。
Developing and benchmarking one health genomic surveillance tools for influenza A virus in wastewater
Nature Communications
- 类型
- 期刊论文
- 范围
- 未分类
为何现在值得关注 优化废水基因组测序技术增强了在同一健康框架下监测甲型流感病毒的能力。这些方法学改进支持对环境样本中多样化及潜在新兴病毒亚型进行常规追踪。
Amira: detection of single and multi-copy antimicrobial resistance genes directly from long reads using gene-space de Bruijn graphs
Genome Biology
- 类型
- 基因组研究
- 范围
- 未分类
为何现在值得关注 从长读长改进耐药基因检测，或可支持文中背景所述的基因型预测与监测工作。
Fatal Post-Influenza Streptococcal Toxic Shock Syndrome Caused by M1UK Streptococcus pyogenes in South Korea: A Case Report
Microorganisms
- 类型
- 基因组研究
- 范围
- 韩国
为何现在值得关注 该特定细菌谱系在该地区的出现，凸显了对侵袭性链球菌感染进行持续基因组监测的重要性。这也强调了在病毒性呼吸道疾病后出现休克的患者中评估中毒性休克综合征的临床必要性。
Multidrug-resistant monophasic Salmonella Typhimurium ST34 strain producing blaNDM-5 carbapenemase isolated from a patient with rectal cancer in Hainan, China: comprehensive whole genome dissection of antibiotic resistance and virulence determinants
Frontiers in Cellular and Infection Microbiology
- 类型
- 基因组研究
- 范围
- Hainan, China
为何现在值得关注 该报告补充了中国某省份耐碳青霉烯沙门菌的基因组细节，并指出此类菌株威胁临床治疗与公共卫生。
High levels of domestic transmission and drug resistance –analysis of national surveillance data for shigellosis, the Netherlands, 2018 to 2024
Eurosurveillance
- 类型
- 期刊论文
- 范围
- 荷兰
为何现在值得关注 将基因组测序纳入常规监测改善了对传播网络的识别，并更快速地提供了耐药趋势的洞察。作者强调，必须持续开展侧重于卫生和认知提升的公共卫生活动，以遏制高耐药菌株的传播。
Multidrug- and rifampicin-resistant tuberculosis in the post-BPaLM era: from genomic resistance prediction to precision treatment, therapeutic failure and transmission control — a comprehensive review
Bulletin of the National Research Centre
- 类型
- 期刊论文
- 范围
- 未分类
为何现在值得关注 耐多药/利福平耐药结核病仍是抗微生物药物耐药性死亡的主要原因。对最新药物的耐药性已经出现,快速耐药检测的诊断能力分布不均。作者提出一个反馈系统,将快速测序、个体化方案、实时毒性和耐药监测以及人群水平基因组监测联系起来,并以公平获取为基础。
Retrospective Whole-Genome Sequencing and Molecular Epidemiological Analysis of Austrian WNV-2 Veterinary Cases (2008-2025).
Pathogens (Basel, Switzerland)
- 类型
- 基因组研究
- 范围
- 奥地利、匈牙利
为何现在值得关注 结果强调，对动物感染开展全面基因组监测可追踪谱系更替，并有助于理解区域病毒进化。
First Identification of an Autochthonous Case of Chikungunya in Guinea
The American Journal of Tropical Medicine and Hygiene
- 类型
- 期刊论文
- 范围
- 几内亚、塞内加尔
为何现在值得关注 该报告提供了几内亚本地获得性基孔肯雅的首例记录证据，提示需加强临床、媒介及全国范围虫媒病毒基因组监测，以评估风险、防范未来疫情。
First record of Phlebotomus sergenti (Diptera: Psychodidae) in China and its potential epidemiological implications
PLOS Neglected Tropical Diseases
- 类型
- 基因组研究
- 范围
- 中国、阿富汗、吉尔吉斯斯坦
为何现在值得关注 作者认为，该发现填补了该物种分布记录的空白，并支持加强监测及跨境合作，以监测中亚地区媒介传播疾病的扩散。这些是论文提出的意义，并不构成当前监测信号的证据。
Genomic characteristics and evolutionary analysis of Bordetella pertussis in Guizhou Province, China
BMC Microbiology
- 类型
- 基因组研究
- 范围
- 中国
为何现在值得关注 研究描述了一个抗原谱与疫苗株存在差异且在本地占主导的大环内酯类耐药谱系，作者认为这与贵州省的疫苗优化和合理临床用药相关。
Genomic Detection of Multidrug-Resistant H58 ST1 Salmonella Typhi in a South African Urban Waterway Reveals Epidemiological Links With Clinical Isolates.
MicrobiologyOpen
- 类型
- 基因组研究
- 范围
- 南非
为何现在值得关注 这是南非地表水中首次检出携带qacEΔ1基因的多重耐药H58型伤寒沙门菌，表明朱克斯凯河可能是耐药伤寒传播的潜在环境储存库。
Emergence of Macrolide-Resistant Bordetella pertussis, Peru, 2025.
Emerging infectious diseases
- 类型
- 基因组研究
- 范围
- 秘鲁
为何现在值得关注 红霉素耐药百日咳鲍特菌的出现表明需加强耐药性监测，以支持百日咳防控策略的制定。
Molecular epidemiology and antimicrobial resistance determinants of Corynebacterium diphtheriae causing infections in Karachi, Pakistan, 2023-2024
International Journal of Infectious Diseases
- 类型
- 基因组研究
- 范围
- 巴基斯坦
为何现在值得关注 结果显示，所采集的卡拉奇分离株包含遗传上多样的菌株、常见的抗菌药物耐药标志物，并且tox基因检测结果与报告的毒素产生情况存在差异。作者认为，基因组监测和改进诊断方法可用于评估传播趋势及毒素产生情况，尤其适用于中低收入国家背景。
Emergence of a Novel, Phenotypically Difficult-to-Detect Vancomycin-Resistant Enterococcus faecium Clone (ST117/CT7799).
MicrobiologyOpen
- 类型
- 基因组研究
- 范围
- 奥地利
为何现在值得关注 该克隆表现出难以检出的耐药表型，暴露出现有诊断流程的重大缺陷，可能延误感染防控与监测响应。
A tiered molecular surveillance framework linking rapid dengue detection to genomic epidemiology in Senegal
International Journal of Infectious Diseases
- 类型
- 基因组研究
- 范围
- 塞内加尔
为何现在值得关注 这些发现提供了塞内加尔登革热、寨卡和基孔肯雅热共同检出的文章层面背景，并描述了一种结合混合筛查、快速血清分型和测序的监测流程。摘要将该流程描述为一种在资源有限环境中可能具有可扩展性的方案。
Clinical and population genomic epidemiology of invasive group A streptococcus in Scotland, 2014-2024
Journal of Infection
- 类型
- 基因组研究
- 范围
- 未分类
为何现在值得关注 研究结果为苏格兰疫情后侵袭性A组链球菌感染增加提供了人群层面和基因组学背景，并不支持将新出现的高毒力emm1克隆作为本研究所识别的解释。