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同行评议开放获取伤寒副伤寒

Genomic epidemiology and antimicrobial resistance reveal local transmission dynamics of enteric fever in Shenzhen, one of the mega cities in China

Journal of Infection·

Yixiang Jiang, Min Jiang, Xin Lu, Meiying Yan, Xiaolu Shi, Qinghua Hu, Biao Kan

DOI
10.1016/j.jinf.2025.106469
PMID
40058502
PMCID
OpenAlex
W4408241531
研究类型
Genomic study
出版商
Elsevier BV
文章类型
journal-article
完整性状态
current

为何这项研究现在值得关注

绘制这些遗传和耐药模式有助于当局预测传播路径,并在人口密集地区优先开展监测工作。

01

结构化证据摘要

研究问题

该研究旨在绘制中国主要城市中心流行的病原体株系及其传播模式,为公共卫生干预措施提供信息。

研究设计

研究人员将系统基因组测序与跨越十余年的历史流行病学记录相结合。

人群与场景

分析使用了2001年至2017年间从中国深圳个体采集的细菌分离株。

主要发现

测序显示伤寒沙门菌株系存在显著变异,突出两个主要遗传群及一个与特定耐药标记相关的独特谱系,同时发现持续流行的多重耐药变异株。甲型副伤寒沙门菌表现出一致的遗传特征,分子聚类识别出多条局部传播链和跨省病原体流动。尽管一线抗生素治疗对大多数样本仍然有效,但可测量比例的菌株表现出广泛耐药性。

公共卫生意义

绘制这些遗传和耐药模式有助于当局预测传播路径,并在人口密集地区优先开展监测工作。

重要局限

本摘要仅限于所提供的文摘和元数据;查阅完整手稿对于决策级解读是必要的。

GIDS 解读

该文献为特定都市队列提供基线基因组和耐药数据,为区域追踪框架提供参考材料,但不涉及实时警报生成。

02

相关 GIDS 监测

文献背景不会验证、解释或改变监测信号;精确关系与背景关系会分开展示。

03

证据关系

本文与疾病、地区、主题及研究设计之间有 13 条可审计分类关系。

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