Phylogeny and molecular evolution of the first local monkeypox virus cluster in Guangdong Province, China
Nature Communications·
- DOI
- 10.1038/s41467-023-44092-3
- PMID
- 38086870
- PMCID
- PMC10716143
- OpenAlex
- W4389615694
- 研究类型
- Genomic study
- 出版商
- Springer Science and Business Media LLC
- 文章类型
- journal-article
- 完整性状态
- current
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作者将该研究定位为有助于理解中国持续进行的猴痘疫情，并为制定联防联控策略提供参考。
结构化证据摘要
研究问题
本研究对广东省2023年6月首次本地猴痘疫情期间获得的猴痘病毒(MPXV)基因组序列进行系统发育与分子演化分析，以阐明疫情的来源与传播模式。
研究设计
对广东省2023年6月疫情中获得的10条MPXV全基因组序列进行基因组学与系统发育特征分析，并与日本、葡萄牙及其他中国地区的MPXV序列进行比较分析。
人群与场景
研究背景为2023年6月中国广东省首次本地猴痘疫情；分析样本为来自该疫情的10条MPXV全基因组序列，并以日本、葡萄牙和中国其他地区的MPXV序列作为比较背景。
主要发现
广东省全部10条MPXV序列均归属于IIb C.1谱系，在系统发育信号上呈现时间连续性，并具有独特的突变特征，表现为随时间推移单核苷酸多态性(SNP)与共享突变持续增加。与日本MPXV相比，广东毒株表现出更高的基因组核苷酸差异，并相对B.1谱系病毒分离出14个共享突变，其中包括6个位于与宿主调控、病毒感染及病毒生命周期相关基因中的非同义突变。文中指出与APOBEC3相关的突变模式是IIb C.1的显著特征。
公共卫生意义
作者将该研究定位为有助于理解中国持续进行的猴痘疫情，并为制定联防联控策略提供参考。
重要局限
摘要指出仅依靠流行病学数据未能快速确定疫情来源与传播，提示可供基因组分析利用的流行病学背景存在局限。此外，本综述仅依据所提供的单篇论文摘要与元数据，需查阅原文方可获得决策级别的解读。
GIDS 解读
本文为2023年12月发表于Nature Communications的同行评审基因组学研究，归入基因组流行病学、疫情调查与传播动力学类别，适合作为关于中国广东省MPXV IIb C.1谱系出现与多样化演化的背景文献。所提供的证据未将该论文与任何实时监测信号相联系。
相关 GIDS 监测
文献背景不会验证、解释或改变监测信号；精确关系与背景关系会分开展示。
证据关系
本文与疾病、地区、主题及研究设计之间有 9 条可审计分类关系。