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同行评议开放获取人感染高致病性禽流感流行性感冒胃肠炎

Emerging highly pathogenic H5 avian influenza viruses in France during winter 2015/16: phylogenetic analyses and markers for zoonotic potential

Eurosurveillance·

François-Xavier Briand, Audrey Schmitz, Katell Ogor, Aurélie Le Prioux, Cécile Guillou-Cloarec, Carole Guillemoto, Chantal Allée, Marie-Odile Le Bras, Edouard Hirchaud, Hélène Quenault, Fabrice Touzain, Martine Cherbonnel-Pansart, Evelyne Lemaitre, Céline Courtillon, Hélène Gares, Patrick Daniel, Alexandre Fediaevsky, Pascale Massin, Yannick Blanchard, Nicolas Eterradossi, Sylvie van der Werf, Véronique Jestin, Eric Niqueux

DOI
10.2807/1560-7917.es.2017.22.9.30473
PMID
28277218
PMCID
PMC5356430
OpenAlex
W2592609485
研究类型
Genomic study
出版商
European Centre for Disease Control and Prevention (ECDC)
文章类型
journal-article
完整性状态
current

为何这项研究现在值得关注

研究对法国新发H5禽流感病毒进行了早期基因组与表型评估,并明确分析了与跨物种传播及大流行风险相关的分子标志。

01

结构化证据摘要

研究问题

研究关注2015/16年冬季在法国西南部家禽养殖场新出现的高致病性H5禽流感病毒的跨物种传播潜力与进化来源。

研究设计

对三株代表性分离株(H5N1、H5N2、H5N9)进行分子检测、活体内静脉致病性指数(IVPI)实验,以及基于新一代测序的全基因组系统发育分析。

人群与场景

自2015年11月起在法国西南部家禽养殖场中检测到新型高致病性H5禽流感病毒的环境背景。

主要发现

三株分离株均对家禽表现高致病性,其中H5N1分离株的IVPI为2.9,且三者共享此前未在H5高致病性禽流感病毒中报道的多碱性HA切割位点序列(HQRRKR/GLF)。全基因组系统发育分析显示各分离株的八个基因片段均属于欧亚禽源谱系,与Gs/Gd/1/96-like谱系不同。这些病毒保留多数禽源分子特征,缺乏与哺乳动物呼吸道有效传播相关的关键标志,作者据此预测其当时不具有显著的大流行潜力。

公共卫生意义

研究对法国新发H5禽流感病毒进行了早期基因组与表型评估,并明确分析了与跨物种传播及大流行风险相关的分子标志。

重要局限

本综述仅依据所提供的单篇文献摘要与元数据,需查阅原始论文方可得出决策级解读;现有证据除分离株数量较少外,未明确列出研究局限性。

GIDS 解读

该文章可通过基因组流行病学、同一健康与传播动力学分类标签(关联法国及H5N1/流感)被发现,有助于检索欧洲新发H5禽流感事件背景资料的用户定位此文献。

02

相关 GIDS 监测

文献背景不会验证、解释或改变监测信号;精确关系与背景关系会分开展示。

03

证据关系

本文与疾病、地区、主题及研究设计之间有 11 条可审计分类关系。

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